S13-11 09

Análisis de secuencias de ADN basadas en la metodología STEAM

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Daniel Barranco ÁlvarezFacultad de Educación, Universidad del Atlantico Medio

Enfoque

Introducción: El análisis de secuencias ADN es una práctica frecuente en el campo de las ciencias experimentales y de la salud, que puede tener un objetivo múltiple. Desde el estudio de la evolución de los diferentes linajes de especies que habitan el planeta tierra hasta el análisis de las mutaciones que determinan la aparición y evolución de enfermedades con una base genética. A partir de los años 70, comenzaron a aparecer los primeros estudios en la literatura científica que pusieron de manifiesto técnicas efectivas para la secuenciación de genes aislados; y un poco más adelante, en la década de los 90 comenzaron a aparecer los primeros genomas completos secuenciados, que en su mayoría pertenecían a organismos modelo de los seres vivos. Sin olvidar que el desarrollo las técnicas de obtención de secuencias de ADN ha ido de la mano la obtención de herramientas informáticas que permiten su análisis de una forma cada vez más eficiente. Sin embargo, aunque se ha producido un gran desarrollo en este campo en la ciencia experimental, rara vez se llevan a cabo en un aula de educación prácticas de análisis de secuencias de ADN, mostrando al alunado la realidad del trabajo diario en este campo.

Objetivos: El objetivo principal de este trabajo es mostrar cómo llevar a cabo prácticas educativas de análisis de secuencias de ADN en Educación Secundaria Obligatoria, Bachillerato o Formación Profesional (rama sanitaria). Para ello, se plantean los siguientes objetivos específicos: análisis de las herramientas disponibles en el mercado para el análisis de ADN, análisis de bases de datos disponibles donde poder descargar las secuencias de ADN, diseño de actividades posibles a llevar a cabo en cada etapa educativa.

Metodología: El análisis de las herramientas disponibles para el análisis de secuencias de ADN se realizó en función del coste del uso de la herramienta, facilidad de uso y posibilidades a la hora de diseñar actividades. El análisis de bases de datos disponibles para la obtención de las secuencias de ADN se realizó teniendo en cuenta, la facilidad de obtención de secuencias y la cantidad de secuencias disponibles. Por último, el diseño de las actividades se realizó teniendo en cuenta la metodología STEAM (enseñanza de ciencias de forma integrada) y el currículo de cada etapa educativa.

Resultados y conclusión: Una de las bases de datos más completas para la obtención de secuencias de ADN es Genebank (Librería Nacional de Medicina; USA), que permite además realizar sencillos análisis de similitud de secuencias de ADN. Existen otras bases de datos para la obtención de secuencias de ADN que son específicas de organismos modelo de los seres vivos como Arabidopsis thaliana o Drosophila melanogaster. Las herramientas estudiadas para el análisis de secuencias de ADN permiten visualizar la propia secuencia, realizar alineamientos, comparar secuencias y realizar análisis rápidos de reconstrucciones evolutivas. Las actividades diseñadas se centran en la aplicación de contenidos de biología evolutiva, ciencias de la salud, matemáticas e informática mostrando un trabajo de las ciencias de forma integral, combinando diferentes disciplinas.

Preguntas y comentarios al autor/es

Hay 09 comentarios en esta ponencia

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      Santiago Vidal Puig

      Comentó el 03/08/2023 a las 16:14:28

      Hola Daniel
      me parece una propuesta muy interesante. Particularmente trabajo en estadística y muchos de mis compañeros trabajan con datos de DNA con temas punteros de investigación. La Estadística no solo permite la simple obtención de estimaciones de ciertos parámetros si no que son la base y recurso de una buena investigación. Por supuesto es en equipos multidisciplinares donde la investigación se potencia.
      Saludos y espero leer más de ti en próximos congresos en relación a esta propuesta.

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      Juan Jose Gutierrez Gonzalez

      Comentó el 22/07/2023 a las 20:51:13

      Hola, no me queda muy claro que es la metodología STEAM. Hay algún portal web que pueda explicar en que se basan estas metodologías? Muchas gracias

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      Javier Carbone Campoverde

      Comentó el 14/07/2023 a las 18:22:14

      Estimado Daniel
      En terminos generales, cuales son las principales barreras que nos podemos encontrar en la actividad docente sobre secuenciación de ADN en alumnos de formación profesional. Es recomendable tener un minimo básico de conocimientos previos?.

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        Daniel Barranco Álvarez

        Comentó el 14/07/2023 a las 19:20:39

        Buenas tardes Javier
        Como como mínimo los alumnos deben conocer como es la estructura química de la molécula de ADN, y tener nociones básicas sobre las bases de la herencia, para poder entender el archivo con la secuencia que te descargas de las bases de datos que contiene la secuencia y el fundamento básico de las actividades.

        Un saludo
        Daniel

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      Ana Couso Viana

      Comentó el 14/07/2023 a las 10:39:25

      Buenos días Daniel,
      me parece una propuesta muy interesante y bonita para acercar el trabajo de investigación en biología molecular al alumnado de enseñanza media. Enhorabuena!
      Veo en tu respuesta a otro comentario que ya has implementado esta experiencia en ciclos de FP, ¿Cuáles eran las mayores dificultades conceptuales que encontraban?
      ¿Has pensado en incluir en la actividad alguna parte de análisis de expresión de los genes estudiados? Existen atlas de expresión de genes en Arabidopsis thaliana (http://bar.utoronto.ca/efp2/Arabidopsis/Arabidopsis_eFPBrowser2.html?) y con ellos se puede estudiar además de las secuencias de por sí, la expresión en distintos órganos y fases del desarrollo. ¿Crees que son conceptos demasiado difíciles para los niveles de ESO?

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        Daniel Barranco Álvarez

        Comentó el 14/07/2023 a las 11:07:15

        Buenos días Ana,
        Muchas gracias por tu comentario. Las mayores dificultades que encontraron los alumnos fue entender que cuando se trabaja con secuencias de ADN para dar respuesta a un problema para la toma de decisiones se utiliza la estadística; y entender los conceptos estadísticos que hay detrás de este tipo de análisis es complejo. Sobre todo porque los alumnos de FP están acostumbrados a extraer ADN, amplificar secuencias y comparar el resultado en una electroforesis de agarosa de forma visual sobre el gel.

        Muchas gracias por el recurso que has añadido sobre expresión en A. thaliana, si duda bajo mi punto de vista mientras más completas sean las actividades y mejor se muestre a los alumnos el trabajo real en un laboratorio mejor.

        En cuanto a la dificultad de estas actividades para trabajar a nivel de ESO, depende de como se plantee la actividad; te pongo un ejemplo, en 4 de ESO cuando se trabajan los temas de evolución, en ocasiones se hacen ejercicios con los alumnos de reconstrucción de pequeños árboles filogenéticos por similitud de caracteres morfológicos o danto alguna información temporal de la aparición de los taxones de la actividad. Creo que en esa misma situación de aprendizaje se puede hacer la misma actividad pero utilizando secuencias de ADN y haciendo una reconstrucción filogenética sencilla (utilizando cualquiera de los programas que aparecen en la charla) y un procedimiento de reconstrucción sencillo (como la máxima verosimilitud o parsimonia). Sin entrar con demasiado detalle en el procedimiento estadístico que hay detrás, si considero que se pueden implementar actividades en de este tipo en este curso, lo que a fin de cuentas muestra al alumno como se hace el trabajo realmente en el campo de la biología evolutiva.

        Un saludo
        Daniel

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      Eva Cabanelas Dopazo

      Comentó el 13/07/2023 a las 22:20:42

      Buenas tardes Daniel. Lo primero de todo, te felicito por la propuesta, me ha parecido muy interesante. Personalmente, le veo mucho potencial como actividad o proyecto a realizar en Biología y Geología de 4º ESO, ya que como comentabas se aborda genética molecular y evolución. Todo lo relacionado con el ADN suele motivar mucho al alumnado. No sé si has tenido la oportunidad de implementar la propuesta en alguna de las etapas que comentas. En caso afirmativo, ¿cuál ha sido la respuesta del alumnado? ¿qué dificultades se han encontrado? Muchas gracias por tu aportación, exploraré las herramientas que nos has presentado. Saludos!

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        Daniel Barranco Álvarez

        Comentó el 13/07/2023 a las 22:51:57

        Buenas tardes Eva,

        Muchas gracias por las felicitaciones. Si, he podido realizar actividades de análisis de secuencias de ADN, en mi caso las desarrollé en un centro de formación profesional de rama sanitaria con alumnos a partir de 18 años. Las actividades que he llevado a cabo han estado centradas en la identificación del origen de muestras biológicas a través del uso de las secuencias de ADN (típico ejemplo de escena de un crimen y sospechosos o típico caso de búsqueda de paternidad). El tipo de secuencias de utilicé con los alumnos fueron secuencias de ADN de tipo microsatélite, que son las que se utilizan realmente en estos casos y están disponibles en genebank. El software que utilicé en este caso, era uno específico para secuencias de este tipo Genemaker; es un poco antiguo pero sigue siendo gratuito frente a otras opciones más modernas como geneiuos o genemapper (con las que puedes hacer algo durante las versiones de prueba gratuitas).

        La respuesta de los alumnos fue muy positiva aunque como siempre costó un poco enseñarles el manejo de la herramienta y hacerles entender que al final aunque estemos con trabajo de laboratorio las decisiones se toman analizando datos y utilizando la estadística.

        Yo también considero que para 4 de ESO se pueden diseñar actividades interesantes, es un buen curso por la edad de los alumnos y por no disponer de la presión de bachillerato. Aunque sea en el curso que sea, bajo mi punto de vista, lo importante es mostrar a los alumnos cómo es el trabajo real con este tipo de muestras.

        Un saludo
        Daniel


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